Yazar "Cansaran Duman, Demet" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    Bitkilerde RNA interferans
    (Refik Saydam Hıfzıssıhha Merkezi Başkanlığı, 2015) Aras, Sümer; Soydam Aydın, Semra; Fazlıoğlu, Aslı; Cansaran Duman, Demet; Büyük, İlker; Derici, Mehmet Kürşat
    R RNA interferans (RNAi) mekanizması, hücreye giren çift zincirli RNA’nın (dsRNA) komplementeri olan mRNA zincirinin degradasyonuna yol açması ile sonuçlanan transkripsiyon sonrası gen susturma (post-transcriptional gene silencing), ya da gen ifadesinin düzenlenmesi olarak tanımlanır. RNAi mekanizması sırasında, hedef mRNA’ya komplementer dizi, 500 kDa ağırlığında ve nükleaz aktiviteli bir RNA-multi protein kompleksi olan RISC faktörü aracılığı ile mRNA’nın anlamlı dizisine bağlanır ve gen susturulma mekanizması bu RISC faktörü aracılığı ile kontrol edilir. Gen susturulması mRNA’nın RISC faktöründe bulunan ‘Argounate’ proteinle etkileşime girmesi ve ‘Dicer’ enzimi tarafından tanınıp kesilmesi ile gerçekleşir. Bu mekanizma, genomun virüs kalıtım materyali ve transpozonlar gibi hareketli genetik elementlerin istilasından korunmasını sağlamak amacıyla gerçekleşen doğal bir işlemdir. RNAi mekanizması, ökaryot organizmalarda iki tür molekül tarafından gerçekleştirilir. Bu moleküller 22 nükleotid uzunluğunda miRNA (micro RNA) ve 21- 23 nükleotid uzunluğunda, çift zincirli siRNA (small interfering RNA) molekülleridir. Son yıllarda bilim dünyasının önde gelen konuları arasında yer alan RNAi araştırmaları ile çeşitli organizmalarda genlerin işlevlerini inceleme, işlevlerini bilmediğimiz genlerin fonksiyonlarını belirleme, konak patojen ilişkisi, üreme, programlanmış hücre ölümü, tümör oluşumu gibi birçok alanda bilgi sahibi olunmuştur. Ayrıca; bitkilerde kodlanmayan RNA’ların doku farklılaşması ve gelişiminin kontrolü, sinyal iletimi, fitohormonlarla etkileşim, abiyotik (kuraklık, tuzluluk vb.) ve biyotik (patojenler vb.) stres gibi çevresel etmenlere verilen cevaplarda rol oynadığı görülmüştür. Bu derleme çalışmasında RNAi mekanizmasının temelleri ve bitkilerde RNAi kullanımı açıklanmaya çalışılacaktır.
  • [ X ]
    Öğe
    Usnic acid causes apoptotic-like death in Leishmania major, L. infantum and L. tropica
    (Springer Verlag, 2018) Derici, Mehmet Kürşat; Cansaran Duman, Demet; Taylan Özkan, Hikmet Ayşegül
    Leishmaniasis, a deadly parasitic infection, threatens many people worldwide. Since the high cost, toxicity, and resistance are drawbacks of current treatment options, it is necessary to find safer and more effective new antileishmanial drugs. The aim of this study was to determine the antileishmanial activity of usnic acid and its apoptotic mechanism on Leishmania spp. promastigotes. The antileishmanial activity was evaluated by MTT assay and apoptosis-related gene expression was investigated by qRT-PCR. Usnic acid was to be effective against Leishmania major, L. infantum, and L. tropica promastigotes at IC 50 = 10.76 µg/ml, 13.34 µg/ml, and 21.06 µg/ml, respectively. We also demonstrated a novel mechanism by which usnic acid inhibited proliferation and caused apoptosis; usnic acid upregulated p53, Bax, Casp-3, and Casp-9 gene expression and downregulated the level of Bcl-2 gene expression. Accordingly, the expression level of the P53 gene increased in L. major, L. infantum and L. tropica by 14.4-, 11.8-, and 9.5-fold, respectively, and in contrast, the Bcl-2 gene expression decreased in all three leishmaniasis by 0.8-, 0.8-, and 0.7-fold, respectively. The present study, therefore, revealed that usnic acid played a critical role in the usnic acid-induced apoptotic process in Leishmania species. Usnic acid is easily accessible and an inexpensive agent, and can be considered as an alternative therapeutic agent for Leishmania infections subject to further tests in animal models. © 2018, Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature.