ACAN Gene VNTR Polymorphism and Intervertebral Disc Degeneration in a Turkish Population

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorÖz, Tuba
dc.contributor.authorKaya, İsmail
dc.contributor.authorNursal, Ayşe Feyda
dc.contributor.authorAydın, Hasan Emre
dc.contributor.authorDemir, Osman
dc.contributor.authorYiğit, Serbülent
dc.date.accessioned2021-11-01T18:15:01Z
dc.date.available2021-11-01T18:15:01Z
dc.date.issued2020
dc.department[Belirlenecek]
dc.description.abstractAim: Intervertebral disc degeneration (IVDD) is caused by several genetic and environmental factors. Aggrecan is the major component of intervertebral disk matrix proteoglycan with multiple functional domains. The aim of this study was to investigate the possible association between ACAN (coding aggrecan) gene variable number tandem repeat (VNTR) polymorphism and susceptibility to IVDD. Methods: Two hundred and sixty subjects participated in this study. The disease group comprised 150 patients diagnosed with symptomatic IVDD. The control group consisted of 110 healthy subjects. The ACAN gene VNTR region was analyzed using the polymerase chain reaction (PCR) method. Results: The most common allele in the patient and the control group was 27 repeat allele (49% and 34.55%, respectively). Allele 26 was more frequent in males compared to females (p=0.030). Allele 21 and 23 were more common in ones living in rural areas (p=0.030) while allele 27 was the most frequent in ones living in urban areas (p<0.001). Allele 26, allele 29 and allele 30 were less frequent in the patient group than in the control group (p=0.013, p=0.001 and p=0.001, respectively) while allele 27 was more common in the patient group compared to the control group (p=0.001). Conclusion: Our results showed that ACAN VNTR allele 27 had a positive relationship with IVDD susceptibility in a Turkish population.
dc.description.abstractAmaç: İntervertebral disk dejenerasyonu (İVDD) çeşitli genetik ve çevresel faktörlerden kaynaklanır. Agrekan intervertebral disk matrisi proteoglikanın çoklu fonksiyonel etki alanlarına sahip ana bileşenidir. Bu çalışmanın amacı ACAN (agrekan kodlayan) gen değişken sayılı ardışık tekrar (VNTR) polimorfizmi ve İVDD yatkınlığı arasındaki olası ilişkiyi araştırmaktır. Yöntemler: ACAN VNTR polimorfizmi ve İVDD arasındaki ilişkiyi incelemek için, 260 kişi bu çalışmaya katıldı. Hasta grubu semptomatik İVDD tanısı alan 150 hastadan oluşmuştu. Kontrol grubu 110 sağlıklı kişiden oluşmuştu. ACAN geni VNTR polimorfizmi polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile analiz edildi. Bulgular: Hasta ve kontrol grubunda en sık görülen alel 27 tekrarlı aleldi (sırasıyla, %49 ve %34,55). Alel 26 erkeklerde kadınlara göre daha sıktı (p=0,030). Alel 27 en fazla şehirde yaşayanlarda bulunurken (p<0,001), alel 21 ve 23 köyde yaşayanlarda fazlaydı (p=0,030). Alel 27 hasta grubunda kontrol grubuna göre artmışken (p=0,001), alel 26, alel 29 ve alel 30 hasta grubunda kontrol grubuna göre azdı (sırasıyla, p=0,013, p=0,001, p=0,001). Sonuç: Sonuçlarımız, Türk popülasyonunda ACAN VNTR alel 27’yi taşıyan kişilerin İVDD yatkınlığı ile pozitif ilişkisi olduğunu göstermiştir
dc.identifier.doi10.4274/haseki.galenos.2020.6006
dc.identifier.endpage314en_US
dc.identifier.issn1302-0072
dc.identifier.issn2147-2688
dc.identifier.issue4en_US
dc.identifier.scopus2-s2.0-85090654738
dc.identifier.scopusqualityQ3
dc.identifier.startpage309en_US
dc.identifier.urihttps://doi.org10.4274/haseki.galenos.2020.6006
dc.identifier.urihttps://app.trdizin.gov.tr/makale/TXpZNE9URTFOUT09
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11491/7642
dc.identifier.volume58en_US
dc.identifier.wosWOS:000568356900001
dc.identifier.wosqualityN/A
dc.indekslendigikaynakWeb of Science
dc.indekslendigikaynakScopus
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.institutionauthorNursal, Ayşe Feyda
dc.language.isoen
dc.relation.ispartofHaseki Tıp Bülteni
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subject[No Keywords]en_US
dc.titleACAN Gene VNTR Polymorphism and Intervertebral Disc Degeneration in a Turkish Population
dc.title.alternativeACAN gen VNTR Polimorfizmi ve Türk Popülasyonundaki İntervertebral Disk Dejenerasyonuen_US
dc.typeArticle

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Makale Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu